MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 12100

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_011981	TTCAG	2	10	600704	600713	20 %	40 %	20 %	20 %	222102916
11502	NC_011981	TGCC	2	8	600749	600756	0 %	25 %	25 %	50 %	222102916
11503	NC_011981	CCA	2	6	600806	600811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102916
11504	NC_011981	CAA	2	6	600843	600848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102916
11505	NC_011981	CAG	2	6	600898	600903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102916
11506	NC_011981	ACC	3	9	600937	600945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102916
11507	NC_011981	GAT	2	6	600987	600992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102916
11508	NC_011981	GAT	2	6	600994	600999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102916
11509	NC_011981	AGCC	2	8	601043	601050	25 %	0 %	25 %	50 %	222102916
11510	NC_011981	GC	4	8	601077	601084	0 %	0 %	50 %	50 %	222102916
11511	NC_011981	CAA	2	6	601104	601109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102916
11512	NC_011981	CCA	2	6	601302	601307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11513	NC_011981	CCCAAT	2	12	601309	601320	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
11514	NC_011981	TTG	2	6	601476	601481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102917
11515	NC_011981	CAA	2	6	601484	601489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102917
11516	NC_011981	GAC	2	6	601512	601517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102917
11517	NC_011981	CGG	2	6	601518	601523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102917
11518	NC_011981	TCA	2	6	601721	601726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102917
11519	NC_011981	GGC	2	6	601784	601789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102917
11520	NC_011981	ACC	2	6	601793	601798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102917
11521	NC_011981	CCGA	2	8	601828	601835	25 %	0 %	25 %	50 %	222102918
11522	NC_011981	ATG	2	6	601866	601871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102918
11523	NC_011981	CTG	2	6	601919	601924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102918
11524	NC_011981	GCAAA	2	10	601964	601973	60 %	0 %	20 %	20 %	222102918
11525	NC_011981	GGCA	2	8	601974	601981	25 %	0 %	50 %	25 %	222102918
11526	NC_011981	GGAAG	2	10	602010	602019	40 %	0 %	60 %	0 %	222102918
11527	NC_011981	TTC	2	6	602069	602074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102918
11528	NC_011981	CGC	2	6	602137	602142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102918
11529	NC_011981	GCA	3	9	602153	602161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102918
11530	NC_011981	CG	4	8	602205	602212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11531	NC_011981	TCAA	2	8	602219	602226	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11532	NC_011981	AG	3	6	602229	602234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_011981	CCAG	2	8	602243	602250	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11534	NC_011981	GCA	2	6	602302	602307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102919
11535	NC_011981	GTC	2	6	602337	602342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102919
11536	NC_011981	CA	3	6	602402	602407	50 %	0 %	0 %	50 %	222102919
11537	NC_011981	CAG	2	6	602465	602470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102919
11538	NC_011981	CGC	2	6	602501	602506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102919
11539	NC_011981	CGC	2	6	602572	602577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102919
11540	NC_011981	GTC	2	6	602633	602638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11541	NC_011981	T	6	6	602809	602814	0 %	100 %	0 %	0 %	222102920
11542	NC_011981	CCG	2	6	602884	602889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102920
11543	NC_011981	GCT	2	6	602899	602904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102920
11544	NC_011981	CCA	2	6	603007	603012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102920
11545	NC_011981	CTGC	2	8	603067	603074	0 %	25 %	25 %	50 %	222102920
11546	NC_011981	CAG	2	6	603126	603131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102920
11547	NC_011981	CCTT	2	8	603132	603139	0 %	50 %	0 %	50 %	222102920
11548	NC_011981	GCA	2	6	603214	603219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102920
11549	NC_011981	GCC	2	6	603251	603256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102920
11550	NC_011981	GCA	2	6	603310	603315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102920
11551	NC_011981	ATC	2	6	603345	603350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102920
11552	NC_011981	CGCC	2	8	603351	603358	0 %	0 %	25 %	75 %	222102920
11553	NC_011981	CAA	2	6	603367	603372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102920
11554	NC_011981	TGC	2	6	603375	603380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102920
11555	NC_011981	TCT	2	6	603385	603390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102920
11556	NC_011981	GCCA	2	8	603436	603443	25 %	0 %	25 %	50 %	222102920
11557	NC_011981	CGG	2	6	603489	603494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102920
11558	NC_011981	TGG	2	6	603511	603516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102920
11559	NC_011981	TGG	2	6	603542	603547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102920
11560	NC_011981	GCA	2	6	603553	603558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102920
11561	NC_011981	GCC	2	6	603755	603760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102920
11562	NC_011981	GGCCC	2	10	603796	603805	0 %	0 %	40 %	60 %	222102920
11563	NC_011981	CTC	2	6	603812	603817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102920
11564	NC_011981	TCA	3	9	603828	603836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102920
11565	NC_011981	CCA	2	6	603837	603842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102920
11566	NC_011981	AG	3	6	603843	603848	50 %	0 %	50 %	0 %	222102920
11567	NC_011981	GCG	2	6	603967	603972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102920
11568	NC_011981	CATC	2	8	604084	604091	25 %	25 %	0 %	50 %	222102920
11569	NC_011981	CAC	3	9	604124	604132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102920
11570	NC_011981	CCA	2	6	604158	604163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102920
11571	NC_011981	GAAAG	2	10	604183	604192	60 %	0 %	40 %	0 %	222102920
11572	NC_011981	ATA	2	6	604215	604220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102920
11573	NC_011981	GCC	2	6	604221	604226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102920
11574	NC_011981	TGG	2	6	604345	604350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102920
11575	NC_011981	CAA	2	6	604363	604368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102920
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11577	NC_011981	GCT	2	6	604534	604539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102921
11578	NC_011981	GCA	2	6	604607	604612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102921
11579	NC_011981	GCC	2	6	604642	604647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102921
11580	NC_011981	CCG	2	6	604649	604654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102921
11581	NC_011981	GCA	2	6	604660	604665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102921
11582	NC_011981	GCA	2	6	604719	604724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102921
11583	NC_011981	GGAAT	2	10	604790	604799	40 %	20 %	40 %	0 %	222102921
11584	NC_011981	GCC	2	6	604848	604853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102921
11585	NC_011981	GGC	2	6	604857	604862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102921
11586	NC_011981	GCC	2	6	604901	604906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102921
11587	NC_011981	GCCA	2	8	604925	604932	25 %	0 %	25 %	50 %	222102921
11588	NC_011981	ATGA	2	8	604942	604949	50 %	25 %	25 %	0 %	222102921
11589	NC_011981	CAT	2	6	605010	605015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102921
11590	NC_011981	TGCC	2	8	605034	605041	0 %	25 %	25 %	50 %	222102921
11591	NC_011981	ACC	2	6	605119	605124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102921
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11593	NC_011981	CGC	2	6	605168	605173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102921
11594	NC_011981	GCG	2	6	605312	605317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102921
11595	NC_011981	CGA	2	6	605436	605441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102921
11596	NC_011981	GCAA	2	8	605447	605454	50 %	0 %	25 %	25 %	222102921
11597	NC_011981	TGAA	2	8	605507	605514	50 %	25 %	25 %	0 %	222102921
11598	NC_011981	GCA	2	6	605792	605797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102922
11599	NC_011981	GCC	2	6	605865	605870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102922
11600	NC_011981	GCA	2	6	605951	605956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102922
11601	NC_011981	A	6	6	606075	606080	100 %	0 %	0 %	0 %	222102922
11602	NC_011981	CCA	2	6	606188	606193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102922
11603	NC_011981	GCA	2	6	606307	606312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102922
11604	NC_011981	CGC	2	6	606394	606399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102922
11605	NC_011981	CTG	2	6	606410	606415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102922
11606	NC_011981	CA	3	6	606485	606490	50 %	0 %	0 %	50 %	222102922
11607	NC_011981	GCC	2	6	606496	606501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102922
11608	NC_011981	CTG	2	6	606560	606565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102922
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11611	NC_011981	CG	3	6	606765	606770	0 %	0 %	50 %	50 %	222102922
11612	NC_011981	GC	3	6	606790	606795	0 %	0 %	50 %	50 %	222102922
11613	NC_011981	CAG	2	6	606810	606815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102922
11614	NC_011981	ACCGCA	2	12	606853	606864	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	222102922
11615	NC_011981	GATC	2	8	606872	606879	25 %	25 %	25 %	25 %	222102922
11616	NC_011981	CAA	2	6	606908	606913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102922
11617	NC_011981	CG	3	6	606949	606954	0 %	0 %	50 %	50 %	222102922
11618	NC_011981	GCT	2	6	606957	606962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102922
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11620	NC_011981	TGC	2	6	607031	607036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102922
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11986	NC_011981	CTG	3	9	625119	625127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102936
11987	NC_011981	GGC	2	6	625211	625216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102936
11988	NC_011981	GT	3	6	625309	625314	0 %	50 %	50 %	0 %	222102936
11989	NC_011981	CGG	2	6	625337	625342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102936
11990	NC_011981	CTG	2	6	625398	625403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102936
11991	NC_011981	TGT	2	6	625570	625575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11992	NC_011981	TTG	2	6	625630	625635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11993	NC_011981	CGA	2	6	625685	625690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11994	NC_011981	GGC	2	6	625857	625862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11995	NC_011981	CCG	2	6	625879	625884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11996	NC_011981	CAA	2	6	625903	625908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11997	NC_011981	AGTC	2	8	625909	625916	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11998	NC_011981	GAA	3	9	625930	625938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11999	NC_011981	CCG	2	6	626164	626169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102937
12000	NC_011981	GCT	2	6	626192	626197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102937

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